本报讯 克日,中国中医科学院中药研究所和安利植物研发中心宣布,使用纳米孔测序手艺突破重大基因组测序,该团队在天下首次完成了菊属植物菊花的全基因组测序,并完成了主要的药用菊花品种——杭白菊的全长转录组遗传信息掘客。相关研究效果和基因组数据已在中国中医科学院中药研究所官网及安利植物研发中心学术研究网站宣布,并向全天下研究菊花的学术团队和非营利组织免费开放。
菊属植物染色体结构重大,包括从2n=18到8n=72之间的种种染色体组结构。生产上作为菊花茶使用的菊花(以著名的杭白菊为例)是一个重大的多倍体物种,由多套二倍体亚基组成。菊属是一个很是大的植物分类单位,包括菊组和苞叶组两大分支。面临菊花重大的染色体遗传结构以及富厚的种质资源多样性,举行菊花基因组测序关于展现菊属物种的起源进化及物种多样性具有主要意义。
团结团队使用纳米孔测序团结二代高通量测序手艺,对漫衍于江苏南京的野菊花品种举行全基因测序、组装、注释及相关剖析,共组装出了约3Gb基因组总长,判断出了101745个编码卵白基因。通过较量研究发明,整个基因组中保存大宗的重复序列,这可能是整个菊属植物基因组较为重大的缘故原由。同时研究职员对多倍体菊花品种杭白菊举行了全长转录组较量剖析,剖析野菊花和杭白菊直接保存极大的遗传上的亲缘关系。